Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC5P28715 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms