Protein–RNA interactions for Protein: P12259

F5, Coagulation factor V, humanhuman

Predictions only

Length 2,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F5P12259 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
F5P12259 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
F5P12259 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
F5P12259 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
F5P12259 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
F5P12259 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
F5P12259 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
F5P12259 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
F5P12259 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
F5P12259 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F5P12259 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
F5P12259 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
F5P12259 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F5P12259 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
F5P12259 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
F5P12259 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
F5P12259 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
F5P12259 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
F5P12259 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
F5P12259 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
F5P12259 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
F5P12259 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
F5P12259 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
F5P12259 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
F5P12259 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
F5P12259 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
F5P12259 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
F5P12259 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
F5P12259 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F5P12259 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
F5P12259 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
F5P12259 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
F5P12259 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F5P12259 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F5P12259 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
F5P12259 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
F5P12259 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
F5P12259 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
F5P12259 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
F5P12259 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
F5P12259 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
F5P12259 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
F5P12259 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
F5P12259 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
F5P12259 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
F5P12259 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
F5P12259 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
F5P12259 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
F5P12259 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
F5P12259 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
F5P12259 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
F5P12259 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
F5P12259 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
F5P12259 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
F5P12259 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
F5P12259 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
F5P12259 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
F5P12259 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
F5P12259 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
F5P12259 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
F5P12259 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
F5P12259 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
F5P12259 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
F5P12259 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
F5P12259 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
F5P12259 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
F5P12259 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
F5P12259 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
F5P12259 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
F5P12259 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
F5P12259 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
F5P12259 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
F5P12259 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
F5P12259 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
F5P12259 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
F5P12259 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
F5P12259 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
F5P12259 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
F5P12259 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
F5P12259 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
F5P12259 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F5P12259 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
F5P12259 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
F5P12259 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F5P12259 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F5P12259 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F5P12259 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
F5P12259 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F5P12259 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
F5P12259 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F5P12259 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
F5P12259 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F5P12259 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F5P12259 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F5P12259 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
F5P12259 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
F5P12259 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
F5P12259 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F5P12259 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
F5P12259 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms