Protein–RNA interactions for Protein: P0DP72

VSIG10L2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10L2P0DP72 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VSIG10L2P0DP72 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VSIG10L2P0DP72 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VSIG10L2P0DP72 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VSIG10L2P0DP72 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VSIG10L2P0DP72 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VSIG10L2P0DP72 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VSIG10L2P0DP72 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VSIG10L2P0DP72 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VSIG10L2P0DP72 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VSIG10L2P0DP72 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VSIG10L2P0DP72 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VSIG10L2P0DP72 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VSIG10L2P0DP72 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms