Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIL1P09327 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
VIL1P09327 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIL1P09327 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIL1P09327 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIL1P09327 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIL1P09327 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIL1P09327 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIL1P09327 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VIL1P09327 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VIL1P09327 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VIL1P09327 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VIL1P09327 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VIL1P09327 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VIL1P09327 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VIL1P09327 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VIL1P09327 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VIL1P09327 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VIL1P09327 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VIL1P09327 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VIL1P09327 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIL1P09327 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
VIL1P09327 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIL1P09327 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIL1P09327 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIL1P09327 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIL1P09327 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
VIL1P09327 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VIL1P09327 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VIL1P09327 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VIL1P09327 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VIL1P09327 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
VIL1P09327 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VIL1P09327 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VIL1P09327 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VIL1P09327 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VIL1P09327 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VIL1P09327 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
VIL1P09327 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
VIL1P09327 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VIL1P09327 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VIL1P09327 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VIL1P09327 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VIL1P09327 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
VIL1P09327 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VIL1P09327 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIL1P09327 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIL1P09327 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIL1P09327 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIL1P09327 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIL1P09327 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIL1P09327 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIL1P09327 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VIL1P09327 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VIL1P09327 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VIL1P09327 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VIL1P09327 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VIL1P09327 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIL1P09327 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIL1P09327 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIL1P09327 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIL1P09327 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIL1P09327 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIL1P09327 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIL1P09327 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIL1P09327 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIL1P09327 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIL1P09327 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIL1P09327 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIL1P09327 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VIL1P09327 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VIL1P09327 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VIL1P09327 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VIL1P09327 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VIL1P09327 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
VIL1P09327 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VIL1P09327 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
VIL1P09327 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VIL1P09327 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VIL1P09327 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VIL1P09327 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VIL1P09327 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VIL1P09327 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VIL1P09327 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VIL1P09327 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VIL1P09327 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VIL1P09327 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VIL1P09327 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VIL1P09327 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VIL1P09327 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VIL1P09327 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VIL1P09327 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VIL1P09327 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VIL1P09327 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VIL1P09327 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
VIL1P09327 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VIL1P09327 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VIL1P09327 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VIL1P09327 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VIL1P09327 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms