Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HLA-DOAP06340 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HLA-DOAP06340 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms