Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOP3BO95985 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms