Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEBLO76041 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEBLO76041 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEBLO76041 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEBLO76041 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEBLO76041 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEBLO76041 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEBLO76041 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEBLO76041 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEBLO76041 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEBLO76041 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEBLO76041 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEBLO76041 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEBLO76041 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NEBLO76041 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEBLO76041 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEBLO76041 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEBLO76041 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEBLO76041 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEBLO76041 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEBLO76041 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEBLO76041 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEBLO76041 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEBLO76041 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEBLO76041 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEBLO76041 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEBLO76041 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEBLO76041 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEBLO76041 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEBLO76041 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEBLO76041 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEBLO76041 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEBLO76041 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEBLO76041 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEBLO76041 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEBLO76041 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEBLO76041 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEBLO76041 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEBLO76041 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NEBLO76041 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEBLO76041 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEBLO76041 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEBLO76041 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEBLO76041 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEBLO76041 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEBLO76041 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEBLO76041 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEBLO76041 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEBLO76041 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NEBLO76041 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEBLO76041 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEBLO76041 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEBLO76041 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEBLO76041 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEBLO76041 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEBLO76041 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEBLO76041 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEBLO76041 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEBLO76041 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEBLO76041 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEBLO76041 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEBLO76041 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEBLO76041 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEBLO76041 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEBLO76041 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEBLO76041 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEBLO76041 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEBLO76041 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEBLO76041 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEBLO76041 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEBLO76041 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEBLO76041 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEBLO76041 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEBLO76041 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEBLO76041 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEBLO76041 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEBLO76041 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEBLO76041 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEBLO76041 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEBLO76041 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEBLO76041 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEBLO76041 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEBLO76041 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEBLO76041 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEBLO76041 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEBLO76041 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEBLO76041 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEBLO76041 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEBLO76041 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEBLO76041 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEBLO76041 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEBLO76041 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEBLO76041 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEBLO76041 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEBLO76041 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEBLO76041 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEBLO76041 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEBLO76041 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEBLO76041 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEBLO76041 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms