Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
ABCC9O60706 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC47.32■■■■■ 5.17
ABCC9O60706 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC47.32■■■■■ 5.17
ABCC9O60706 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC47.32■■■■■ 5.17
ABCC9O60706 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.31■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC47.31■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC47.31■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC47.3■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC47.3■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC47.3■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC47.3■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC47.29■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.28■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.28■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC47.28■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC47.27■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.26■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC47.26■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC47.26■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.26■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC47.25■■■■■ 5.16
ABCC9O60706 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
ABCC9O60706 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.24■■■■■ 5.15
ABCC9O60706 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC47.24■■■■■ 5.15
ABCC9O60706 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC47.24■■■■■ 5.15
ABCC9O60706 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
ABCC9O60706 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
ABCC9O60706 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
ABCC9O60706 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
ABCC9O60706 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.22■■■■■ 5.15
ABCC9O60706 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.22■■■■■ 5.15
ABCC9O60706 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
ABCC9O60706 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
ABCC9O60706 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC47.21■■■■■ 5.15
ABCC9O60706 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC47.21■■■■■ 5.15
ABCC9O60706 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
ABCC9O60706 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
ABCC9O60706 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
ABCC9O60706 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
ABCC9O60706 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC47.19■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.18■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC47.18■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC47.17■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC47.17■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC47.17■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC47.17■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.16■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC47.16■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC47.15■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.15■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC47.15■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC47.15■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC47.13■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC47.13■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC47.13■■■■■ 5.14
ABCC9O60706 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC47.12■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC47.11■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC47.1■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC47.1■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC47.1■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC47.1■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC47.1■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.09■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC47.09■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC47.08■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC47.08■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC47.08■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC47.07■■■■■ 5.13
ABCC9O60706 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC47.06■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC47.06■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC47.05■■■■■ 5.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms