Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NDUFS5O43920 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NDUFS5O43920 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NDUFS5O43920 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NDUFS5O43920 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NDUFS5O43920 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NDUFS5O43920 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NDUFS5O43920 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NDUFS5O43920 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NDUFS5O43920 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NDUFS5O43920 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NDUFS5O43920 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NDUFS5O43920 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms