Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLRMTO00411 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLRMTO00411 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLRMTO00411 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLRMTO00411 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLRMTO00411 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLRMTO00411 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLRMTO00411 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLRMTO00411 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLRMTO00411 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLRMTO00411 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLRMTO00411 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLRMTO00411 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
POLRMTO00411 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLRMTO00411 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLRMTO00411 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
POLRMTO00411 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
POLRMTO00411 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLRMTO00411 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLRMTO00411 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms