Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO7DNF2Z398 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms