Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4orf47A7E2U8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms