Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM23A6NLE4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms