Protein–RNA interactions for Protein: A4QN01

LINC01553, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01553, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01553A4QN01 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC01553A4QN01 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms