Protein–RNA interactions for Protein: V9GYH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYH0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
V9GYH0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
V9GYH0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
V9GYH0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
V9GYH0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
V9GYH0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
V9GYH0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
V9GYH0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
V9GYH0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
V9GYH0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
V9GYH0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
V9GYH0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
V9GYH0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
V9GYH0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
V9GYH0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
V9GYH0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
V9GYH0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
V9GYH0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
V9GYH0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
V9GYH0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
V9GYH0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
V9GYH0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
V9GYH0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
V9GYH0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
V9GYH0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
V9GYH0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
V9GYH0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
V9GYH0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
V9GYH0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
V9GYH0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
V9GYH0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
V9GYH0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
V9GYH0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
V9GYH0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
V9GYH0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
V9GYH0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
V9GYH0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
V9GYH0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
V9GYH0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
V9GYH0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
V9GYH0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
V9GYH0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
V9GYH0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
V9GYH0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
V9GYH0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
V9GYH0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
V9GYH0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
V9GYH0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
V9GYH0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
V9GYH0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
V9GYH0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
V9GYH0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
V9GYH0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYH0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYH0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYH0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYH0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYH0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYH0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYH0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYH0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYH0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYH0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYH0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
V9GYH0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYH0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYH0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYH0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYH0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYH0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYH0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYH0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYH0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYH0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYH0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYH0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYH0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYH0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYH0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYH0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYH0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYH0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYH0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYH0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYH0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYH0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYH0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYH0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYH0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYH0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYH0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYH0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYH0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYH0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYH0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYH0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYH0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYH0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYH0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYH0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms