Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL4A3BPQ9Y5P4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A3BPQ9Y5P4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms