Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G5

PCDHGA8, Protocadherin gamma-A8, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA8Q9Y5G5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA8Q9Y5G5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA8Q9Y5G5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms