Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NOP58Q9Y2X3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms