Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DTX4Q9Y2E6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms