Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORCS3Q9UPU3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms