Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PARP4Q9UKK3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PARP4Q9UKK3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms