Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM5BQ9UGL1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM5BQ9UGL1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM5BQ9UGL1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM5BQ9UGL1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
KDM5BQ9UGL1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
KDM5BQ9UGL1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
KDM5BQ9UGL1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
KDM5BQ9UGL1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
KDM5BQ9UGL1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
KDM5BQ9UGL1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
KDM5BQ9UGL1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
KDM5BQ9UGL1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
KDM5BQ9UGL1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
KDM5BQ9UGL1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
KDM5BQ9UGL1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
KDM5BQ9UGL1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
KDM5BQ9UGL1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
KDM5BQ9UGL1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM5BQ9UGL1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC36.95■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC36.93■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM5BQ9UGL1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
KDM5BQ9UGL1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms