Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFIP11Q9UBB9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TFIP11Q9UBB9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFIP11Q9UBB9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms