Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GPHNQ9NQX3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GPHNQ9NQX3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms