Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN4Q9NQC3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN4Q9NQC3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms