Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASS4Q9NQ75 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms