Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH2

ISYNA1, Inositol-3-phosphate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISYNA1Q9NPH2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ISYNA1Q9NPH2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ISYNA1Q9NPH2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms