Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO1B3Q9NPD5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms