Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNRC6CQ9HCJ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TNRC6CQ9HCJ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNRC6CQ9HCJ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNRC6CQ9HCJ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNRC6CQ9HCJ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRC6CQ9HCJ0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRC6CQ9HCJ0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRC6CQ9HCJ0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRC6CQ9HCJ0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNRC6CQ9HCJ0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNRC6CQ9HCJ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms