Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3GQ9HC16 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
APOBEC3GQ9HC16 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms