Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DCLRE1BQ9H816 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLRE1BQ9H816 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms