Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSER2Q9H7U1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms