Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms