Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NIFKQ9BYG3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms