Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.38
PCGF6Q9BYE7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
PCGF6Q9BYE7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PCGF6Q9BYE7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232.5 ms