Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PACSIN1Q9BY11 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms