Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC106Q9BWC9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC106Q9BWC9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms