Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SGIP1Q9BQI5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SGIP1Q9BQI5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms