Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNL2Q96S94 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNL2Q96S94 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNL2Q96S94 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNL2Q96S94 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNL2Q96S94 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNL2Q96S94 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNL2Q96S94 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNL2Q96S94 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNL2Q96S94 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNL2Q96S94 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNL2Q96S94 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNL2Q96S94 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNL2Q96S94 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCNL2Q96S94 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms