Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARXQ96QS3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARXQ96QS3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.45
ARXQ96QS3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms