Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC2Q96PR1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC2Q96PR1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms