Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC43Q96MW1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC43Q96MW1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms