Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNBD2Q96M20 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms