Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RMDN2Q96LZ7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RMDN2Q96LZ7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RMDN2Q96LZ7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RMDN2Q96LZ7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RMDN2Q96LZ7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RMDN2Q96LZ7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RMDN2Q96LZ7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RMDN2Q96LZ7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RMDN2Q96LZ7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RMDN2Q96LZ7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RMDN2Q96LZ7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RMDN2Q96LZ7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RMDN2Q96LZ7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RMDN2Q96LZ7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RMDN2Q96LZ7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 701.5 ms