Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms