Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGAP3Q96FM1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGAP3Q96FM1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGAP3Q96FM1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGAP3Q96FM1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGAP3Q96FM1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGAP3Q96FM1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGAP3Q96FM1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGAP3Q96FM1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGAP3Q96FM1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PGAP3Q96FM1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGAP3Q96FM1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms