Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW34

TMEM239, Transmembrane protein 239, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM239Q8WW34 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM239Q8WW34 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms