Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN4YQ8NFZ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms