Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTL3Q8N8U3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTL3Q8N8U3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTL3Q8N8U3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms