Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms